靶向药比传统化疗温和一些，但并不代表没有副作用。阿卡替尼长期服用时，患者要留意出血、感染、心律和胃肠道反应。
常见不良反应包括头痛、腹泻、肌肉酸痛、疲乏、上呼吸道感染、皮疹、恶心等。部分患者还可能出现血小板减少、贫血或中性粒细胞减少，复查血常规很重要。
如果出现黑便、鼻出血不止、皮肤大片淤斑、发热寒战、胸闷心悸，应尽快就医。正在使用抗凝药、阿司匹林或有房颤病史的患者，开始阿卡替尼前需要让医生知道。
轻微头痛或腹泻可以先观察，但症状持续加重时不要自行硬扛。
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